По радикалу:
-Неполярные: аланин, валин, изолейцин, лейцин, пролин, метионин, фенилаланин, триптофан;
-Полярные незаряженные (заряды скомпенсированы) при pH=7: глицин, серин, треонин, цистеин, аспарагин, глутамин, тирозин;
-Полярные заряженные отрицательно при pH=7: аспартат, глутамат;
-Полярные заряженные положительно при pH=7: лизин, аргинин, гистидин.
По функциональным группам:
-Алифатические;
-Моноаминомонокарбоновые: глицин, аланин, валин, изолейцин, лейцин;
-Оксимоноаминокарбоновые: серин, треонин;
-Моноаминодикарбоновые: аспартат, глутамат, за счёт второй карбоксильной группы несут в растворе отрицательный заряд;
-Амиды моноаминодикарбоновых: аспарагин, глутамин;
-Диаминомонокарбоновые: лизин, аргинин, несут в растворе положительный заряд;
-Серосодержащие: цистеин, метионин;
-Ароматические: фенилаланин, тирозин, триптофан, (гистидин);
-Гетероциклические: триптофан, гистидин, пролин;
-Иминокислоты: пролин.
По кислотно-основным свойствам:
-Нейтральные: одна NH2- и одна COOH-группы;
-Кислотные: одна NH2- и две COOH-группы;
-Щелочные: две NH2- и одна COOH-группы