Третий этап перестройки (1989-1991) ознаменован изменением политической системы. Первый съезд народных депутатов СССР проходил в мае-июне 1989 года. Была отменена шестая статья Конституции СССР, закрепляющая руководящую роль КПСС в советском обществе. Ослабла власть партийных комитетов. Стала подвергаться критике деятельность руководителей КПСС и государства. От диктата партии стали освобождаться Советы, профсоюз, комсомол. Усилилась конфронтация в обществе, непримиримость политических противников, наклеивание ярлыков.
Знаменем сопротивления консервативных сил стала публикация статьи научного работника из Ленинграда Н.Андреевой «Не могу поступаться принципами» в газете «Советская Россия».
Вопрос о заключении нового союзного договора начал ставиться в 1988 г. представителями национально-демократических движений в Прибалтике.
Отстаивая свою самостоятельность, парламенты республик Прибалтики, а затем Украины, Киргизии и России приняли декларацию о Государственном суверенитете. 25 октября 1990 года Декларацию о государственном суверенитете провозгласил Казахстан. Провозглашен приоритет республиканской власти и законодательства перед союзными.