Метод ПЦР применяется для выявления в клинических образцах вирусов, микобактерий, простейших и бактерий, для обнаружения врожденных и приобретенных генетических нарушений, а также для идентификации личности. Сфера применения ПЦР в диагностике будет постепенно расширяться, поскольку в клинической практике все чаще имеют дело с очень небольшими по размеру биоптатами, получаемыми, например, при эндоскопических исследованиях; или это тонкоигольные аспираты и т.д. В подобных случаях обычный гистологический анализ затруднен. Перечислим, для чего может служить ПЦР.
В иммунологических исследованиях ПЦР чаще всего используется:
• для определения полиморфизма генов, белковые продукты которых участвуют в иммунологических реакциях;
• для определения экспрессии цитокинов, рецепторов цитокинов и других эффекторных молекул;
• для ДНК типирования HLA аллелей и др.
ДНК, выделенную из лимфоцитов, анализируют следующими вариантами ПЦР.
1. ПЦР-праймер со специфической последовательностью (PCRSSP).
2. ПЦР-олигонуклеотидные пробы со специфической последовательностью (PCR-SSOP).
3. ПЦР-рестрикционный анализ продуктов амплификации (PCRRFLP).
4. ПЦР-метод обратной гибридизации амплифицированного фрагмента с олигонуклеотидными зондами, фиксированными на мембране или другой твердой подложке (пластине).