Проводится с метастатическими карциномами печени, доброкачественными опухолями, алкогольными гепатопатиями и другими неопухолевыми заболеваниями печени. Диагностика вторичной опухоли становится очевидной, если выявлен первичный очаг. При циррозе печени – реакция на АФП отрицательная. Кисты печени непаразитарной природы имеют округлую форму, эластичную консистенцию, четкую рентгенологическую картину и характерные проявления при радиоизотопном сканировании. В дифференциальной диагностике эхинококкоза печени имеют значение анамнестические данные, эозинофилия, положительные иммунологические реакции. Инода схожую картину может давать абсцесс печени.