К достоинствам аудита эффективности относят:
1. расширение границ финансового контроля за пределы формальных оценок распределения ресурсов до улучшения экономических объектов их осваивающих;
2. комплексный анализ причин неэффективного использования бюджетных средств в разрезе их получателей;
3. создание условий для борьбы с коррупцией в органах власти путем предоставления информации об использовании бюджетных средств;
4. предоставление законодательным органам власти возможности оценить результативность принятия решений по регулированию бюджетного процесса;
5. обеспечение органов исполнительной власти информацией и рекомендациями по повышению эффективности использования ресурсов;
6. воздействие на разработку стратегических решений в области финансовой политики.