В итоге этапа амплификации создаются условия для третьего этапа глутамат-Са2+ каскада - экспрессии, в течение которого происходят необратимые изменения, приводящие к некротической смерти клетки.
Избыточное внутриклеточное накопление ионов Са2+ и переход Са2+ в активную форму посредством соединения с внутриклеточным рецептором кальмодулином вызывают активацию кальмодулин-зависимых внутриклеточных ферментов: фосфолипаз, протеинкиназ, эндонуклеаз. «Запуск» каскадных ферментативных реакций приводит к множественным повреждениям биомакромолекул и в конечном счете к гибели клеток.
Особенно разрушителен распад фосфолипидов в наружной клеточной мембране и в мембранах внутриклеточных органелл. Уже через несколько минут после начала ишемии отмечается высвобождение из мембран пальмитиновой кислоты и докозогексаеновой кислоты, которое свидетельствует о разрушении фосфатидилхолина и фосфатидилэтаноламина.