Базальные - обязательно необходимые, для связывания РНК-полимеразы с промотором.
- включают фермент PolII +ОТФ (общие факторы транскрипции)
Ко-факторы – это регуляторы транскрипции (коактиватор или корепрессор транскрипции), которые осуществляют свою функцию, не связываясь непосредственно с ДНК. Образуют комплексы с теми факторами транскрипции, которые связываются с ДНК, РНК-полимеразой и промотором.
Специфические факторы
- связываются с промоторами, энхансерами и сайленсерами
-регулируют транскрипцию отдельных генов
О́бщиефа́кторытранскри́пции ОФТ(англ.Generaltranscriptionfactors, GTFs,)— группа белков - факторов транскрипции, которые
· помогают правильно располагать РНК-полимеразу эукариот на промоторе,
· содействуют разделению двух цепей ДНК, чтобы обеспечить возможность начала транскрипции,
· способствуют освобождению РНК-полимеразы от промотора при переходе от инициации транскрипции к элонгации транскрипции.
Название «общие» связано с тем, что они требуются для работы почти всех промоторов, используемых РНК-полимеразой II.
Кроме того, ОФТ взаимодействуют с медиатором,необходимым для правильного взаимодействия с РНК-полимеразой II активаторных белков и ОФТ.
Медиатор – мультибелковый комплекс из 20 белков.
Роль медиатора – перенос сигнала от специфического фактора транскрипции, связанного с энхансером, к РНК-полимеразе II.
Медиатор состоит из головы (образует наибольшее количество контактов с полимеразой),хвоста (платформа для взаимодействия с ген-специфическими активаторами) и тела (выполняетсоединительная функция). Медиатор передаёт полимеразе сигнал от энхансера, который может воспринимать сигналы о том, какие белки нужны клетке в данный момент и усиливать работу гена или группы генов.
Общие транскрипционные факторы обозначаются TFII (от англ.Transcription Factors of RNA polymerase II - фактортранскрипцииРНКполимеразы II).
КчислуОФТотносят TFIIA,TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIG, TFIIH.
ОФТ эукариот выполняют функции, аналогичные функциям σ-субъединице прокариот, кроме того, части TFIIH имеют ту же трёхмерную структуру, что и аналогичные части σ-фактора.
TFIID один из важнейшихобщих факторов, который определяет узнавания элементов промотора.
Основой структуры TFIID является ТВР (TATA-boxBindingProtein) - белок узнающий и связывающийсяс ТАТА-боксом. В состав многосубъединичного фактора TFIID входит TBP-фактор, с ТАТА боксом. С TBP-белком связаны от 8 до 12 белков, которые называются TAF-белки (TBP-associatedfactors - ТВР-ассоциированные белки). Они участвуют в процессах регуляции транскрипции. Субъединицы, входящие в состав TFIID, высококонсервативны и имеют сходные структуры у разных организмов, от дрожжей до человека. Видимо, существовал в глубокой древности общий предковый TFIID.
ТFIIА (3 субъединицы) - стабилизирует связь ТВР с промотором,
ТFIIВ (1 субъединица)- обеспечивает узнавание точки начала транскрипции;
ТFIIF (2 субъединицы) -стимулирует элонгацию,
TFIIE(2 субъединицы)–активируетTFIIH
ТFIIН (7 субъединиц) обеспечиваетрасплетание спирали ДНК, то есть, обладает функцией хеликазы
Специфические факторы транскрипции «сообщают» РНК-полимеразе, какой именно ген необходимо активировать.
Они находятся только в тех клетках, в которых они имеют активировать (или репрессировать) определенный ген.
Промоторы, с которыми они связываются, имеют определенные характерные нуклеотидные последовательности (энхансер или сайленсеры), которые распознают факторы транскрипции и сочетаются с ними.
Специфические факторы транскрипции бывают:
· конститутивные- регулируют скорости транскрипции гена независимо от условий внешней и внутренней среды, обеспечивая:
· инициацию транскрипциb
· основнойуровень транскрипции
· тканеспецифичность транскрипции
· адаптивные-регулируют скорости транскрипции гена в зависимо-сти от условий внешней и внутренней средыв результате взаимодействия с:
коактиваторами (семейство SRC-1, SRA, HATs, TIF1, p68, CBP/p200 и т.д.)
общимифакторами транскрипции (TAFs, TBP, TFIIB, SAGA,
HATs и т.д.)
Последовательность ДНК, с которой связываются факторы транскрипции – это энхансер.
Энхансеры могут располагаться на 5′-и на 3′-концахгена, а также внутринегона разныхрасстоянияхот гена (до 50 тыс. н.п.). Положение энхансера не влияет на его активность.
При связывании энхансеров с факторами транскрипции, ДНК делает изгиб или петлю, сближая энхансер с геном, активность которого он контролирует. Для некоторых генов име-ется несколько энхансеров. Все они при изгибе ДНК собираются в одном месте.
Другая последовательностьДНК - сайленсер, блокирует транскрипцию. Белки группы SIR (sailentinformationрегулятор) связываются с сайленсерами, окупируя при этом большие области ДНК и закрывая, тем самым, доступ факторам транскрипции. При этом репрессируется все гены на расстоянии в несколько тыс.п.н. от сайленсера.