Развернувшиеся военные действия обусловили необходимость проведения определенных изменений в государственном аппарате. 02.09.1918 года ВЦИК своим декретом объявил страну военным лагерем. Деятельность всех органов подчинялась интересам войны. Учреждалась рабочая милиция, которая находится «в ведении Совета Рабочих и Солдатских Депутатов». Главным карательным органом в годы гражданской войны являлась Всероссийская Чрезвычайная Комиссия (ВЧК). В целях объединения всех государственных органов в условиях военного времени был создан Совет рабочей и крестьянской обороны. Воинская обязанность устанавливалась для всего населения, но принцип классового подбора в армию сохранялся. Для руководства военными силами был создан Революционный Военный Совет Республики (РВСР), Реввоенсоветы на фронтах и в армиях.