Протеосома

26S протеосома состоит из сердцевинного каталитического комплекса 20S, ланкированного с двух сторон регуляторными субъединицами 19S. Молекулярная масса 26S протеосомы – 2МДа. За рядом исключений 26S протеосома узнаёт и подвергает протеолизу полиубиквитинированные белки. 20S комплекс построен из четырёх колец: abba (рис. 1). Каждое из колец состоит из семи субединиц. Эти субъединицы кодируются 14 генами: семь кодируют разные a-, семь – разные b-субъединицы. В b-кольцах локализованы три каталитических сайта: сайт, похожий на трипсин (узнаёт остатки тирозина и фенилиаланина), сайт, похожий на химотрипсин (узнаёт остатки лизина и аргинина) и сайт, производящий гидролиз полипептидной цепи после остатка глутамата. Каждый сайт построен из двух, одинаковых b-субъединиц, входящих в состав разных колец.

a-кольца необходимы для стабилизации b-колец, а также для связывания 20S субъединицы с 19S кэпирующими комплексами. 19S кэпирующая субъединица состоит из 2-х частей: основания и крышки. Основание отвечает за связывание с 20S и обладает АТФазной активностью. Крышка отвечает за узнавание полиубиквитинированных белков-субстратов.

Деградация белков, ассоциированных с мембраной

Процессирование белков, ассоциированных с мембраной, отличается от деградации цитоплазматических белков. Основные отличия данного процесса:

1. Деградация осуществляется лизосомами.

2. Для таргетинга белка в лизосомы обычно достаточно моноубиквитинирования. В некоторых случаях формируется полиубиквитиновая цепь.

3. В случае формирования полиубиквитиновой цепи связывание происходит по 63 лизину.