ДНК является хранителем генетической информации во всех клетках про- и эукариот. У вирусов эту функцию может выполнять и РНК.
РНК, как и ДНК, представляет полимер, построенный из мономеров – нуклеотидов. Структура нуклеотидов РНК сходна со структурой нуклеотидов ДНК, но имеются следующие отличия:
1. вместо дезоксирибозы в состав нуклеотидов РНК входит пятиуглеродный сахар – рибоза;
2. вместо азотистого основания тимина – урацил. Остальные три азотистые основания те же: аденин, гуанин и цитозин. Посравнению с ДНК в состав РНК входит меньше нуклеотидов и, следовательно, ее молекулярная масса меньше.
3. известны двух- и одноцепочечные РНК. Двухцепочечные РНК содержатся у некоторых вирусов, выполняя (как и ДНК) роль хранителя и передатчика наследственной информации. В клетках других организмов встречаются одноцепочечные РНК, которые представляют собой копии соответствующих участков ДНК.
В клетках существует три типа РНК: информационная, транспортная и рибосомальная.
Информационная РНК (и-РНК) состоит из 300 – 30000 нуклеотидов и составляет примерно 5% всей РНК, содержащейся в клетке. Она представляет собой копию определенного участка ДНК (гена). Молекулы и-РНК выполняют роль переносчиков генетической информации от ДНК к месту синтеза белка (в рибосомах) и непосредственно участвуют в сборке его молекул.
Транспортная РНК (т-РНК) составляет до 10% всей РНК клетки и состоит из 75 – 85 нуклеотидов. Молекулы т-РНК непосредственно участвуют в биосинтезе белков – транспортируют аминокислоты из цитоплазмы в рибосомы.
Основную часть РНК цитоплазмы (около 85%) составляет рибосомальная РНК (р-РНК). Она входит в состав рибосом. Молекулы р-РНК состоят из 3 – 5 тыс. нуклеотидов. Считают, что р-РНК обеспечивает определенное пространственное взаиморасположение и-РНК и т-РНК.
Репликация молекулы ДНК.
Репликация молекул ДНК происходит в синтетический период интерфазы. Каждая из двух цепей «материнской» молекулы служит матрицей для «дочерней». После репликации вновь синтезированная молекула ДНК содержит одну «материнскую» цепочку, а вторую – «дочернюю», вновь синтезированную (полуконсервативный способ). Для матричного синтеза новой молекулы ДНК необходимо, чтобы старая молекула была деспирализована и вытянута. Репликация начинается в нескольких местах молекулы ДНК. Участок молекулы ДНК от точки начала одной репликации до точки начала другой называется репликоном. «Бактериальная хромосома» содержит один репликон, а эукариотическая – содержит много репликонов.
Начало репликации активируется праймерами (затравками), состоящими из 100 – 200 пар нуклеотидов. Фермент ДНК-хеликаза раскручивает и разделяет материнскую спираль ДНК на 2 нити, на которых по принципу комплементарности при участии ДНК-полимеразы собираются «дочерние» цепи ДНК. Фермент ДНК-топоизомераза скручивает «дочерние» молекулы ДНК. В каждом репликоне ДНК-полимераза может двигаться вдоль «материнской» нити только в одном направлении (5´ => 3´). На лидирующей нити по мере раскручивания репликона постепенно и непрерывно наращивается «дочерняя» цепь. На отстающей нити дочерняя цепь синтезируется также в направлении (5´ => 3´), но отдельными фрагментами (Оказаки) по мере раскручивания репликона. Таким образом, присоединение комплементарных нуклеотидов «дочерних» нитей идет в противоположных направлениях (антипараллельно). Репликация во всех репликонах идет одновременно. Фрагменты Оказаки и части «дочерних» нитей, синтезированные в разных репликонах, сшиваются в единую нить ферментом лигазой. Репликация характеризуется полуконсервативностью, антипараллельностью и прерывистостью (фрагменты Оказаки). Весь геном клетки реплицируется один раз за период времени, соответствующий одному митотическому циклу.
Биосинтез белков.
Информация о первичной структуре белковой молекулы закодирована последовательностью нуклеотидов в соответствующем участке молекулы ДНК – гене. Посредник, копирующий и передающий эту информацию, - информационная РНК (и-РНК). Специальный фермент (РНК-полимераза) расщепляет двойную цепочку ДНК, и на одной из ее цепей (кодирующей) по принципу комплементарности выстраиваются нуклеотиды РНК. Таким образом, синтезированная молекула и-РНК является комплементарной копией одной из цепочек ДНК. Этот процесс называется транскрипцией. Молекула и-РНК выходит в цитоплазму через ядерные поры и располагается в малой субъединице рибосомы.
Система записи генетической информации в ДНК (и-РНК) в виде определенной последовательности нуклеотидов называется генетическим кодом.
Свойства генетического кода:
1. Триплетность – одной аминокислоте в полипептидной цепочке соответствуют три расположенных рядом нуклеотида молекулы ДНК (и-РНК); минимальная единица функции – триплет (кодон).
2. Вырожденность (избыточность) – количество возможных триплетов 64, а аминокислот – 20, поэтому одну аминокислоту может кодировать несколько триплетов.
3. Неперекрываемость – один нуклеотид входит в состав только одного триплета.
4. Универсальность – у всех живых организмов одинаковые триплеты кодируют одинаковые аминокислоты.
5. Однонаправленность считывания (5´ => 3´)
6. Среди триплетов генетического кода есть такие, которые не кодируют аминокислот. Они являются «nonsens»-кодонами (терминаторами), обозначающими конец синтеза данной полипептидной молекулы. К ним относятся в ДНК: АТТ, АЦТ, АТЦ; в РНК: УАА, УГА, УАГ.
Таблица 3. Триплетный код
Название аминокислоты | Соответствующие кодоны (триплеты) |
Аланин | ГЦУ, ГЦЦ, ГЦА, ГЦГ |
Аргинин | ЦГУ, ЦГЦ, ЦГА. ЦГГ, АГА, АГГ |
Аспарагин | ААУ, ААЦ |
Аспарагиновая кислота | ГАУ, ГАЦ |
Валин | ГУУ, ГУЦ, ГУА, ГУГ |
Гистидин | ЦАУ, ЦАЦ |
Глицин | ГГУ, ГГЦ, ГГА, ГГГ |
Глутамин | ЦАА, ЦАГ |
Глутаминовая кислота | ГАА, ГАГ |
Изолейцин | АУУ, АУЦ, АУА |
Лейцин | ЦУУ, ЦУЦ, ЦУА, ЦУГ, УУА, УУГ |
Лизин | ААА, ААГ |
Метионин | АУГ |
Пролин | ЦЦУ, ЦЦЦ, ЦЦА, ЦЦГ |
Серин | УЦУ, УЦЦ, УЦА, УЦГ, АГУ, АГЦ |
Тирозин | УАУ, УАЦ |
Треонин | АЦУ, АЦЦ, АЦА, АЦГ |
Триптофан | УГГ |
Фенилаланин | УУУ, УУЦ |
Цистеин | УГУ, УГЦ |
Начало синтеза | АУГ |
Стоп-сигнал | УАА, УГА, УАГ |
Следующий этап в биосинтезе белка – перевод последовательности нуклеотидов молекулы и-РНК в последовательность аминокислот полипептида – трансляция. Транспортные РНК (т-РНК) «приносят» аминокислоты в большую субъединицу рибосомы. Молекула т-РНК имеет сложную конфигурацию и похожа по форме на лист клевера. На верхушке расположен триплет свободных нуклеотидов, которые по своему генетическому коду соответствуют определенной аминокислоте (антикодон); на другом 5´ конце располагается гуанин, а на 3´ конце триплет ЦЦА. Каждая т-РНК может переносить только свою аминокислоту. Процесс узнавания своей аминокислоты называется рекогницией. Аминокислота присоединяется к аденину триплета ЦЦА с образованием аминоацил-т-РНК (фермент аминоацил-т-РНК-синтетаза и АТФ). Энергии этой связи достаточно для образования в последующем пептидной связи.
Начальный этап трансляции называется инициацией; при этом к рибосоме всегда присоединяется метионин-т-РНК. Сам процесс трансляции (образование пептидных связей) называется элонгацией, а окончание трансляции – терминацией.
Внутри большой субъединицы рибосомы в каждый данный момент находится всего два кодона и-РНК: один – в аминоацильном, а один – в пептидильном центрах. Т-РНК с аминокислотой подходит к аминоацильному центру рибосомы, если антикодон т-РНК является комплементарным кодону и-РНК, то происходит временное присоединение т-РНК с аминокислотой к кодону и-РНК. После этого рибосома передвигается на один кодон и-РНК, и т-РНК с аминокислотой перемещается в пептидильный центр, а к освободившемуся аминоацильному центру рибосомы приходит новая т-РНК с аминокислотой и устанавливается там, если антикодон т-РНК является комплементарным кодону и-РНК. С помощью ферментов между аминокислотами, находящимися в рибосоме, устанавливается пептидная связь. Одновременно разрушается связь между первой аминокислотой и ее т-РНК, а также т-РНК и и-РНК, и т-РНК уходит из рибосомы за следующей аминокислотой. Рибосома опять перемещается на один триплет и процесс повторяется. Считывание информации идет в одном направлении 5´ => 3´.
Так постепенно наращивается молекула полипептида, в которой аминокислоты располагаются в строгом соотношении с порядком кодирующих их триплетов (колинеарность). На заключительном этапе (терминация) рибосома доходит до одного из «nonsens»-кодонов и-РНК: УАА, УГА, УАГ, и синтез полипептида прекращается.