Одно из отрицательных проявлений деятельности человека в природе связано с нарушением системных связей, что может привести к разрушению экосистем или к переходу их в другое состояние.
Универсальное свойство экосистем — их эмерджентность (от англ. етег^еш; — возникновение) заключается в том, что целое всегда имеет особые свойства, отсутствующие у его частей. Иначе говоря, система — это целое, которое больше, чем сумма составляющих его частей. Недоучет эмерджентности может привести к крупным просчетам при вмешательстве человека в жизнь экосистем или при моделировании систем.
Системный подход в биологии позволил получить представление о сообществах живых организмов и их отношений со средой, что привело к формированию таких понятий, как «экосистема» и «биоценоз» —ключевых понятий в экологии.