Компетенция военных судов сформулирована в статье 25 ГПК РФ. В соответствии с данной статьей военные суды рассматривают дела в случаях предусмотренных ФКЗ. В данном случае имеется в виду ФКЗ «О военных судах». В соответствии со статьей 7 этого ФКЗ военные суды рассматривают гражданские и административные дела о защите нарушенных или оспариваемых прав, свобод и законных интересов военнослужащих и граждан, проходящих военные сборы, от действий и бездействий органов военного управления, воинских должностных лиц и принятых ими решений.
В соответствии с разъяснениями постановления пленума ВС РФ №9 от 14 февраля 2000 года пунктом 3 военные суды также рассматривают дела по искам граждан уволенных с военной службы и граждан прошедших военные сборы, если эти граждане обжалуют действия или бездействия органов военного управления и воинских должностных лиц, имевшее место в период прохождения военной службы или воинских сборов.
Специализированные суды
Статья 25 предусматривает также подсудность специализированных судов. Их существование предусмотрено статьей 26 ФКЗ «о судебной системе». На сегодняшний день таких судов пока не создано.