Каталитическая активность катализатора может резко снижаться, а иногда влияние катализатора полностью подавляется, в присутствии ничтожно малых количеств некоторых веществ, которые называются каталитическими ядами. Типичными ядами некоторых катализаторов гидрирования являются соединения серы (H2S, CS2, тиофен, меркаптаны), сильные кислоты и их соли, соединения фосфора, мышьяка, свинца и др. Примечательно, что практически все они являются ядами и для большинства живых организмов. Характерно, что они обладают кумулятивным действием. Считается, что в большинстве случаев отравление катализатора происходит в результате адсорбции яда на поверхности и блокировки активных центров катализатора. Так как адсорбция может быть как обратимой, так и необратимой, то и отравление может быть соответствующим. Так, платиновый катализатор отравляется СО и СS2, однако, при внесении его в чистую смесь исходных веществ, его активность восстанавливается, при отравлении же H2S и РН3 – платина дезактивируется необратимо.
Железный катализатор при пропускании влажного газа теряет свою активность в 5 – 6 раз, но при омывании сухой смесью азота с водородом восстанавливает ее полностью.
Количество яда, достаточное для полного прекращения каталитической активности, чаще всего много меньше, чем его необходимо для полного покрытия поверхности монослоем. Это говорит о том, что каталитическая реакция протекает не на всей поверхности катализатора, а только на отдельных ее участках, так называемых «активных центрах». Понятие о роли активных центров общепринято, и основной задачей считается выяснение их природы, а так же механизма элементарной стадии каталитического процесса.
Иногда в реакционную смесь специально вводят яды, для того чтобы замедлить процесс протекания побочных процессов.