Процессинг транскриптов синтезируемых РНК-полимеразой III

РНК-полимераза III (pol III) ответственна за синтез довольно разнообразного набора транскриптов – молекул 5S-рРНК, транспортных РНК, U6-мяРНК, 7SL-РНК сигнал распознающих частиц и нескольких малых цитоплазматических РНК (называемых Y-РНК в противоположность U-РНК, локализованным в ядре). В дополнение к большому разнообразию функций, выполняемых этими РНК, транскрипты, синтезируемые РНК-полимеразой III отличаются большим разнообразием механизмов процессинга, которым они подвергаются.

Процессинг 5S рРНК

5S рРНК связывается с 28S рРНК и 5,8S рРНК с образованием большой субчастицы рибосомы. Однако в отличие от других рибосомных РНК - 5S рРНК кодируется отдельным геном, транскрибируется другой РНК-полимеразой и подвергается иному варианту процессинга. Действительно, 5S рРНК отличается наиболее простой «судьбой» среди всех РНК-транскриптов эукариот. Она не подвергается кэпированию, а сохраняет 5^/-трифосфатную группировку, характерную для стадии инициации синтеза первичного транскрипта. Молекула 5S РНК не подвергается ни сплайсингу, ни полиаденилированию. Это единственная известная эукариотическая РНК, которая синтезируется зрелой, не требующей процессинга. Ее 5^/- и 3^/-концы защищены от деградации вторичными структурами, стабилизированными прочными взаимодействиями комплементарных пар оснований, и связанными с ними белками, как в случае с другими стабильными молекулами рРНК. У одних видов первичный транскрипт гена 5S рРНК представляет собой уже полностью зрелый продукт, делая его единственным известным примером эукариотической цитоплазматической РНК, которая не подвергается процессингу. У других видов 3^/-концы первичных транскриптов подравниваются экзонуклеазами до образования зрелой формы. Этот минимальный процессинг 5S рРНК у эукариот находится в сильном контрасте с ситуацией у прокариот, у которых 5S рРНК транскрибируется в составе единого крупного предшественника пре-рРНК и нуждается в процессинге 5^/- и 3^/-концов. К слову, матричные РНК прокариот используются непосредственно в виде первичных транскриптов.