На данном этапе на основе системного проекта и принятых решений по автоматизации осуществляется проектирование системы. Этот этап подразделяется на два подэтапа:
1. Проектирование архитектуры системы, включающее разработку структуры и интерфейсов ее компонент, определение информационных потоков между основными компонентами, связей между ними.
2. Детальное проектирование каждой компоненты, включающее разработку спецификаций каждой компоненты, разработку требований к тестам и плана интеграции компонент, а также построение моделей иерархии программных модулей и проектирование внутренней структуры модулей.
При этом происходит расширение системного проекта за счет его уточнения, за счет построения моделей автоматизированных рабочих мест.