В классическом труде "Учение о нефти" (1932 г.) И.М.Губкин изложил свои представления о происхождении нефти, условиях формирования нефтяных месторождений, в этом труде, заложившем основы геологии нефти, Губкин разработал вопросы первичности и вторичности нефтяных залежей, миграции нефти и газа и классификации нефтяных залежей; здесь же им намечены закономерности распределения нефтяных залежей и подвергнуты резкой, принципиальной критике ошибки многих ученых по важнейшим проблемам нефтяной геологии. И.М.Губкиным было создано учение о закономерностях распределения и происхождения грязевых вулканов, установлена их связь с нефтяными месторождениями. Большую теоретическую и практическую ценность имели работы И.М.Губкина о создании нефтяной базы между Волгой и Уралом. В работе "Урало-Волжская нефтеносная область" (1940 г., посмертно) И.М.Губкин показал промышленные перспективы "Второго Баку".