Представление о популяции самоопылителей как совокупности чистых линий сформулированы под влиянием классической работы В.Л. Иоганнсена (1903 г.) «О наследовании в популяциях и чистых линиях».
В результате исследования сортов фасоли и ячменя Иоганнсен сделал вывод о том, что отбор в чистых линиях (внутри семьи) неэффективен.
Источником внутрисемейной изменчивости В. Иоганнсен считал только вариацию условий произрастания для отдельных растений, тогда как в генетическом отношении семьи представляли собой чистые линии.
Несмотря на выводы Иоганнсена о структуре популяции у самоопыляющихся растений, отбор по количественным признакам у многих самоопылителей оказался эффективным.
Самооплодотворение не препятствует сохранению изменчивости популяции.
Наиболее полные исследования вопроса о структуре популяций самоопылителей были выполнены в 1950-60 гг. и обобщены в работе Р.Алларда и др. (1968 г.).