Общий подход к выявлению

В МЕТАБОЛИЧЕСКОЙ СЕТИ СИММЕТРИИ

Как уже отмечалось, поиск симметрии в метаболической сети может быть осуществлен, исходя из представлений о симметрии, как свойстве объектов состоять из закономерно связанных сходных частей. Ввиду сложности метаболической сети присутствие в ней симметрии далеко не очевидно, и одного определения симметрии для целей ее обнаружения оказывается недостаточно. Поэтому решение задачи выявления в метаболической сети симметрии потребовало разработки специального методического подхода. В теоретических исследованиях используют два основных метода познания - индуктивный и дедуктивный. Индуктивный метод позволяет сформулировать общие положения и принципы. Дедуктивный - использует эти положения и принципы для более систематического исследования предмета. Кроме того, будучи применен к изложению научного материала, дедуктивный метод придает ему необходимую компактность и стройность. В данном случае для исследования метаболической сети с целью поиска в ней симметрии нашли применение оба метода. Так, на основе индуктивного анализа материала о метаболизме были сформулированы два принципа, характеризующие общие свойства метаболической сети. Далее эти принципы были использованы для дедуктивного доказательства наличия в метаболической сети простых симметричных комплексов реакций. Эти комплексы были названы симметричными формами. Выявленные симметричные формы использовались в дальнейшем для нахождения в метаболической сети более сложных проявлений симметрии.

Несмотря на то, что используемые принципы характеризуют свойства метаболической сети весьма приближенно, а методика выявления симметричных форм может показаться несколько формальной, принятый в настоящей главе дедуктивный способ изложения материала имеет то преимущество, что позволяет составить более четкое представление о характере присутствующей в метаболической сети симметрии.

Таким образом, в настоящей главе излагается общий теоретический подход к выявлению в метаболической сети симметричных форм и рассматриваются их конкретные примеры.

Принципы, характеризующие свойства структуры