Дерматансульфат представляет собой протеогликан, широко распространенный в тканях животных. По структуре он сходен и с хондроитинсульфатом, и с гепарансульфатом.
Его отличие от хондроитинсульфата состоит в том, что вместо GlcUA, соединенной с GalNAc b1,3-связью, он содержит IdUA, соединенную с GalNAc a1,3-связью. Образование IdUA, как и в случае гепарина и гепарансульфата, происходит путем 5-эпимеризации GlcUA. Как и при образовании гепарина, реакция эпимеризации тесно сопряжена с сульфированием гексозамина. Таким образом, дерматансульфат содержит 2 вида повторяющихся дисахаридных единиц: IdUA–GalNAc и GlcUA–GalNAc.