Для микробиологического анализа обычно используют спинномозговую жидкость, взятую врачом при люмбальной пункции или при пункции боковых желудочков мозга.
Взятие спинномозговой жидкости проводят как можно раньше, желательно до начала антибактериального лечения. Проба отбирается со строгим соблюдением правил асептики. Свежевзятый ликвор из шприца без иглы над спиртовкой вносят в стерильную (желательно центрифужную пробирку) в количестве 1-2 мл и немедленно доставляют в лабораторию, т.к. некоторые микроорганизмы, (например, N. menigitidis, быстро погибают). Допускается хранение спинномозговой жидкости при 370 С в течение нескольких часов. Для пересылки ликвора используют изотермальныеящики, грелки, термос или любую другую упаковку, где поддерживается температура около 370 С.