| Шифр | Название | Катализируемая реакция |
| 3.4.15.1. | Дипептидил карбоксипептидаза | Полипептидил-дипептид + Н2О → Полипептид + Дипептид |
| 3.4.16.2. | Пролин карбоксипептидаза | Пептидилпролил-L-аминокислота + Н2О → → Пептидилпролин + L-аминокислота |
| 3.4.17.1. | Карбокси- пептидаза А | Пептидил-L-аминокислота + Н2О → Пептид + L-аминокислота |
| 3.4.21.1. | Химотрипсин | Преимущественное расщепление пептидов по СО-группам Tyr, Trp, Phe, Leu |
| 3.4.21.4. | Трипсин | Преимущественное расщепление пептидов по СО-группам Arg, Lys |
| 3.4.21.7. | Плазмин | Преимущественное расщепление фибрина по СО-группам Lys, Arg |
| 3.4.21.9. | Энтеропептидаза | Селективное расщепление связи Lys-Ile в трипсиногене |
| 3.4.21.36 | Эластаза | Преимущественное расщепление пептидов по СО-группам Gly, Ala, Val, Leu, Ile |
| 3.4.23.1. | Пепсин | Преимущественное расщепление пептидов по СО-группам Phe, Leu |
| 3.4.23.15 | Ренин | Селективное расщепление связи Leu-Leu в ангиотензиногене |






