2.1. Діагноз на захворювання птиці енцефаломієлітом ставиться на підставі аналізу епізоотологічних даних, клінічних ознак, патолого-анатомічних, гістологічних змін та ізоляції збудника захворювання - вірусу енцефаломієліту. Крім того, ставлять біопробу та проводять ретроспективну діагностику (РНГА, ІФА).
2.2. Для виділення вірусу від хворих курчат відбирають головний мозок, підшлункову залозу, селезінку, у дорослої птиці - ферментативні органи, селезінку, підшлункову залозу.
2.3. Ізольований вірус ідентифікують у реакції нейтралізації із специфічною сироваткою або в інших серологічних дослідженнях.
2.4. Діагноз на ІЕМ уважається встановленим при наявності клінічних ознак, характерних патолого-анатомічних змін, епізоотичних даних та підтвердження лабораторними дослідженнями з постановленням біопроби.