Традиційні ЕМК корисні у відношенні вдосконалення документообігу і ряду завдань, що відповідають поняттю медико-технологічного процесу. Впровадження в їх склад модулів, що забезпечать допомогу медичним працівникам в різноманітних ситуаціях, акцентуючи їх увагу на особливостях протікання хвороб, вважається одним з найбільш перспективних напрямків інформатизації клінічної медицини. Подібні системи, в які вбудовані модулі прийняття рішень, що спрацьовують автоматично при вводі певної інформації, або такі, що вмикаються при запиті для оцінки стану чи проведення розрахунків, використовуючи зібрану в ЕМК інформацію, називають гібридними, на відміну від інтегрованих інформаційних систем, сформованих в результаті об'єднання однотипних за своєю направленістю систем обробки інформації.
Наприклад, у гібридній системі для відділення термічної травми реалізовано формування ряду розрахункових показників та вказівок про можливі патологічні процеси при введенні даних про певні ознаки: розрахунок площі ураження по електронній сітці, що є візуальним уявленням тіла людини, розрахунок об'єму інфузійної терапії в залежності від складності ураження і віку пацієнта, визначення шоку в залежності від введених клінічних даних, розрахунок індексу ризику інфекційних ускладнень. На основі даних про тяжкість стану потерпілого, площі і глибині враження шкірних покровів та інших показників активізується схема обстеження і лікування індивідуально для кожного пацієнта.
В склад автоматизованого генетичного реєстру можуть бути включені різноманітні системи підтримки прийняття рішень: аналіз родоводу, розрахунок генетичного ризику, вибір методів дослідження. Експертна система аналізу родоводу для автоматичного визначення характеру спадковості функціонує з використанням генетичної інформації, що отримується шляхом запитів з бази даних реєстру. На виході лікар отримує висновок про ймовірність появи в пацієнта моногенного захворювання і його типові спадкування, що супроводжуються фактором впевненості. Ряд математичних моделей і програмний комплекс, що їх реалізує, забезпечує розрахунок повторного ризику захворювання в сім'ях. Інтелектуальний модуль з питань призначення обстежень, за підозри на спадкові порушення обміну, що містить інформацію про специфічні для кожного конкретного діагнозу лабораторні зміни, запускається при висуненні лікарем гіпотези про діагноз.
Отже, перехід до гібридних ЕМК передбачає комплексне забезпечення потреб лікарів при прийнятті рішень.