Основными очагами сопротивления большевикам стали Дон и Кубань, Украина, Восточная Сибирь.
Первыми восстали против большевиков донские казаки. Казаки не нуждались в каких-либо новых землях, но стремились сохранить то, что имели. На Дону стал формироваться очаг антибольшевистского сопротивления - Добровольческая армия во главе с генералами М. В.Алексеевым, Л. г. Корниловым, А. И.Деникиным. Весной 1918 г. началась военная интервенция. Германские и союзные им войска, поддерживая националистическое правительство Украины - Раду, вошли в Киев, захватили Крым, часть Северного Кавказа, всю Прибалтику. В марте 1918 г. в связи с угрозой захвата Петрограда немцами большевистское правительство переехало в Москву, которая вновь стала столицей России. Румыния оккупировала Бессарабию. Страны Антанты, не признавшие Брестский мир, начали боевые действия на севере России. Весной 1918 г. английский экспедиционный корпус захватил Мурманск. На Дальнем Востоке появились японцы, а за ними войска англичан, французов и американцев. Позже, после поражения Германии в Первой мировой войне, страны Антанты расширили свою интервенцию в России. Между ведущими державами было заключено соглашение о разделе ее на сферы влияния. Однако непосредственно в боевых действиях войска Антанты участвовали мало. Гораздо большее значение имела их помощь антибольшевистским силам оружием, снаряжением.
Наиболее угрожающим участком для большевиков стали Поволжье и Сибирь. В мае 1918 г. восстал чехословацкий корпус, размещенный на всем протяжении Транссибирской железной дороги. В состав корпуса входили бывшие военнопленные. 26 мая силами корпуса был взят Челябинск, а через несколько недель чехословаки взяли под контроль города вдоль Транссиба - Омск, Томск, Екатеринбург. Успешное наступление чехов было поддержано эсерами, которые организовали в Самаре Комитет из депутатов Учредительного собрания (Комуч), призвавший крестьянство вести непримиримую борьбу против большевизма. Ряд городов Поволжья примкнул к комитету.
8 сентября в Уфе было созвано совещание оппозиционных сил, на котором было сформировано Временное всероссийское правительство - Уфимская директория, в состав которой вошли правые эсеры, кадеты и представители генералитета. Противоречий между эсерами и царскими генералами, которые требовали возврата земли бывшим владельцам, привели к краху Директории.
На территории, остававшейся под контролем большевиков, действовали многочисленные подпольные группы, состоявшие в основном из эсеров. Их методы борьбы с большевиками были схожи с теми, какие использовались ими ранее в борьбе против самодержавия - покушения, забастовки, террор. «Союз защиты Родины и свободы», возглавляемый эсером Б. Савинковым, 6 июля 1918 г. захватил Ярославль, но вскоре был разгромлен. В крупных городах совершались террористические акты. В августе был убит председатель Петроградской ЧК М. С. Урицкий и ранен В. И.Ленин.
Летом 1918 г. положение большевиков стало крайне сложным.
Большевистская власть контролировала лишь территорию вокруг Москвы. Украину захватили немцы, Дон и Кубань - генералы П. Н. Краснов и А. И. Деникин, Поволжье перешло под власть Комуча и чехословацкого корпуса.