В соответствии с возложенными задачами СББР состоит из подразделения радиационного контроля (ПРК) и передвижной лаборатории радиационного контроля (ПЛРК).
ПРК состоит из группы радиометрии, дозиметрии и спектрометрии (ГРДС), группы индивидуального дозиметрического контроля и средств индивидуальной защиты (ГИДКЗ) и группы оценки радиационной обстановки (ГОРО).
ПЛРК состоит из мобильной группы радиометрии, дозиметрии и спектрометрии (ГРДС-М) и мобильной группы оценки радиационной обстановки (ГОРО-М).
Для успешной реализации задач, возложенных на СББР (ПРК и ПЛРК), в состав СББР в случае непредвиденного осложнения радиационной обстановки включаются или дополнительно привлекаются к ее деятельности следующие подразделения: радиационно-гигиеническое, информационно-техническое, экстренной и специализированной медицинской помощи для решения задач, возникающих в ходе проведения аварийно-спасательных, радиационно-гигиенических и лечебно-профилактических работ.