Сцепленное наследование наблюдается, если гены, отвечающие за разные признаки, располагаются в одной паре гомологичных хромосом. Сцепление может быть полным или неполным.
При полном сцеплении гены, расположенные в одной хромосоме, наследуются вместе.
В этом случае скрещивание дигетерозиготы
и рецессивной дигомозиготы
приводит к появлению двух фенотипов, полностью повторяющих фенотипы родителей.
Дигетерозигота образует два вида гамет:
и
, а дигомозигота — один
.
У потомства генотипы такие же, как у родителей:
и
— поэтому и фенотипы совпадают.
Пример:
Скрещивание рецессивной дигомозиготной самки дрозофилы с дигетерозиготным самцом.
При скрещивании рецессивной по обоим признакам самки, имеющей тёмное тело и короткие крылья, с дигетерозиготным доминантным самцом образовалось 50 % серых мух с длинными крыльями и 50 % мух с тёмным телом и короткими крыльями.

Неполное сцепление генов наблюдается, если гены расположены в хромосоме далеко друг от друга. При скрещивании дигетерозиготы и рецессивной гомозиготы получается 4 класса различных фенотипов. При этом происходит образование новых генотипов, полностью отличающихся от родительских.
В этом случае в процесс образования гамет вмешивается кроссинговер.
Дигетерозигота
образует не два, а четыре вида гамет: некроссоверные —
,
(больше) и кроссоверные —
,
(меньше).
При их соединении с гаметами дигомозиготы
образуются четыре генотипа и четыре фенотипа: в большем количестве — нерекомбинанты
и
, в меньшем количестве — рекомбинанты
и
.
Пример:






