Контрольная панель

Программный модуль Chem3D в данной работе используется только как графический редактор трехмерных моделей химических соединений, поэтому далее будут рассмотрены лишь некоторые функции главного меню и главной панели.

Пункт меню File (Файл) содержит стандартный набор возможностей для открытия, сохранения и печати файлов.

Пункт меню Edit (Правка) предоставляет обычный набор функций копирования, вставки, отмены последнего действия и выбора.

Пункт меню View (Вид) предоставляет широкий ассортимент настроек вида молекул/связей/панелей и т.д. Практически в этом пункте полностью присутствуют все функции главной панели.

(Главная панель)- отображает панели: стандартную, построения, модели, поверхности, вычисления, статус-строка;

- обзор панели инструментов;

- показать панель ChemDraw, в открывшемся окне ChemDraw контекстным меню можно вызвать редактор ChemDraw и отредактировать модель.

- декартова таблица координат модели;

- Таблица Z- матрицы;

Таблица измерений;

- результаты расчетов:

- блок комментариев;

- диаграмма двугранного угла;

- модель молекулы в плоскостях X-Y,X-Z,Y-Z;

- способы изображения модели:

- структура в пространстве,

- стержневая модель;

- шаростержневая модель;

- цилиндрические связи;

- объемная модель;

- отображает символы атомов;

- отображает номера атомов;

- показать точечные поверхности атомов;

- показать атомы H и лиганды;

- красный и синий цвета атомов;

- различные оттенки;

- стерео пары;

- перспектива;

- исчезновение с ростом глубины;

.

Контекстное меню в любой точке панелей окна открывает выкидное меню с основными пунктами меню/Вид и пунктом Настройка…, при выборе которого открывается окно Настройка, позволяющее настроить панели инструментов и вывести на панели необходимые команды.

Пункт меню Structure (Структура) предлагает инструменты настройки отображения различных параметров молекулы, а также измерения длин связей, межатомных расстояний и углов.

Пункт Measurement (Измерения) содержит выкидное подменю с пунктами: Bond Lengths (определить длины связей), Bond Angles (определить углы между связями), Dihedral Angles (определить двугранные углы), Close Contacts (определить ближайшие связи), Clear (Очистить весь список).

Функции определения длины связей, углов между связями и двугранных углов позволяют измерить и при необходимости изменить соответствующие расстояния и углы в модели молекулы. Для того чтобы воспользоваться ими, необходимо выделить с помощью мыши атомы, образующие нужную связь или формирующие нужный угол, и выбрать соответствующую функцию. Результат измерения будет отображен в открывшемся окне Измерения в поле Текущий. Кроме того, в поле Оптимальный будет отображено значение данной величины, принятое в качестве стандартного для выбранной связи или угла. Если выбрать по очереди все функции для определения связей и углов, то все результаты измерений отобразятся в одном окне Измерения.

При необходимости изменить выделенное расстояние между атомами или угол, следует набрать требуемое значение в поле Текущий и нажать клавишу ввода или щелкнуть мышкой в окне редактора.

При нажатии клавишей мыши в какой-либо строке поля Оптимальный или поля Текущий на фигуре цветом выделится та часть модели, к которой относится данное измерение (длины связи, углы и т.д.).

Если изменить, например, значение длины связи в поле Текущий, Enter, то можно увидеть, как отразится на модели внесенное изменение длины связи.

Два клика мышкой по строке заголовка Измерения сворачивает окно, при этом появляются полосы прокрутки.

Окно Измерения можно очистить, изменить его размеры, закрыть.

В окне рис.3.2 представлена молекула Ацетона, для которой показаны названия атомов, их номера, точечные поверхности (электронное облако),

открыта панель ChemDraw, в окне Измерения показаны результаты измерения величин связей и углов.

По умолчанию контрольная панель инструментов располагается в левой части окна, и имеет небольшой набор необходимых средств. При желании её можно перетащить в любую часть окна.

Кнопка (Select Tool)позволяет выбрать индивидуальные атомы или связи. С помощью нажатой кнопки Shift можно выбрать группы атомов или связей.