Стремление Хивинского ханства установить власть над сырдарьинскими казахами, направление военных сил для сбора налогов, насильственная мобилизация приаральских казахов для постройки крепостей - все это вызывало восстания.
Батыр Жанкожа Нурмухамед-улы в 1843 году разрушил кокандскую крепость на Куандарье, уничтожил хивинский военный отряд в 1845 году.
В 1853 году русские войска заняли Акмешит (Ак-Мечеть), возникла Сырдарьинская военная линия. Территория от Раима (Аральск) до Акмешита отошла под контроль царских войск. Сбор податей усилился. Двойное угнетение вело к обнищанию. Принуждение казахов к строительству крепостей послужило причиной их восстания в 1856-1857 годах, которое возглавил Жанкожа-батыр. Он превратил Жанакалу в центр восстания. 9 января 1857 года в урочище Арыкбалык карательный отряд Фитингофа разгромил повстанцев. Многие казахские султаны, старшины и влиятельные лица признали власть царского правительства.
18 июня 1847 года в районе реки Жем (Эмбы) Есет-батыр Котибар-улы напал на карательный отряд из Оренбурга. Лишь в 1858 г. Есет-батыр признал царскую власть..
В 50-е годы XIX века Кокандское ханство угнетало население Южного Казахстана, взыскивая многочисленные налоги. Дети должников продавались на рынках Средней Азии. Весной 1858 года восставшие окружили кокандские гарнизоны в Аулие-Ате, Шымкенте, Токмаке. Под Пишпеком повстанцы разгромили кокандские войска. Восстание было стихийно, слабо организовано. Казахские феодалы пошли на соглашение с кокандскими правителями. После некоторых уступок со стороны Худияр хана, замены правителя Ташкента, летом 1858 года восстание было прекращено. Против непокорных были посланы войска.