Как правило, контагиозный моллюск имеет благоприятное течение и даже в отсутствие лечения редко приводит к развитию осложнений. Возможными осложнениями данного заболевания являются:
Присоединение бактериальной инфекции с развитием воспаления кожи (дерматит). После лечения дерматита на коже обычно остаются рубцы.
Появление множественной сыпи с крупными элементами, достигающими нескольких сантиметров в диаметре - встречается редко, указывает на выраженное снижение иммунитета (например, у ВИЧ-инфицированных больных)