Основные таксономические категории (род, вид, подвид)

В классификации Bergey используются следующие группы или уровни (таксоны):

Царство – лат. Regnum;

Домен –Domen;

Филум – Phylum (тип – лат.). В классификации прокариотов для обозначения этого таксона используется термин «филум», а для эукариотов – «тип»;

Класс –Class;

Порядок – Ordo;

Семейство – Familia;

Род – Genus;

Вид – Species.

Таким образом, основной таксономической единицей является вид.

 Вид бактерии - это совокупность микроорганизмов, имеющих единое происхождение и генотип, сходных по морфологическим и биологическим признакам.

Для обозначения некоторых совокупностей микроорганизмов, отличающихся по тем или иным свойствам внутри вида, употребляется суффикс «вар» (разновидность, вариант), поэтому микроорганизмы в зависимости от характера различий обозначают как:

морфовары – по морфологическим свойствам;

хемовары – по биохимическим свойствам;

серовары – по антигенной структуре;

фаговары – по чувствительности к типовым бактериофагам;

колициновары – по продукции бактериоцинов;

резистенсвары – по устойчивости к антибиотикам;

геновары – по строению части генома;

биовары – по культуральным (биологическим) признакам.

Установление принадлежности к роду и виду называется идентификацией бактерий. Для идентификации необходимо изучить все свойства микроорганизмов, обнаружить эти свойства в мире микроба.

Идентификация микроорганизма происходит по набору следующих свойств:

· тинкториальный (свойства бактерий, грибов и простейших, характеризующие их способность вступать в реакцию с красителями и окрашиваться определенным образом.),

· культуральных,

· биохимических,

· факторов патогенности,

· антигенных свойств,

· отношение к фагам.

Для облегчения идентификации предложены специальные идентификационные ключи для определенных групп микроорганизмов - это наборы признаков для микроорганизма – семейства, рода и вида. Идентификации подвергаются исключительно чистые культуры организма.

Культура м/о – микробы одного вида выращенные в лабораторных условиях на искусственных питательных средах. Могут быть чистыми и смешанными.

Колония – это макроскопическое скопление бактерий одного вида, которые являются потомством одной бактериальной клетки, на поверхности или в глубине плотной питательной среды.

Чистая культура м/о – это популяция клеток (видимый рост) одного вида, выросшая на стерильной питательной среде методом механического разобщения.

Штамм – разные микробные культуры одного вида, выделенные из различных источников или из одного источника, но в разное время. Могут быть идентичными или различаться по отдельным признакам. (водным штамм, фекальный штамм)

Клон – генетически однородная популяция микроорганизмов, полученная из одной микробной клетки.

Популяция – совокупность микроорганизмов одного вида, выросшая в данном объеме среды за определенное время. Например, популяция Salmonella typhi северных регионов отличается от популяции южных регионов.

Описание таксономических единиц в определителях даются в следующем порядке.

1. Структурные особенности (форма, размер, специфика спорообразования, движение, культуральные свойства, окраска по Граму);

2. Биохимические свойства и характер питания;

3. Физиологические свойства (потребность в кислороде, температурные условия, рН, чувствительность к антибиотикам);

4. Экологические особенности;

5. Генетические особенности;

6. Характер штаммов.

 

Название вида микроорганизмов в соответствии с бинарной номенклатурой.

Согласно бинарной номенклатуре название вида микроорганизма состоит из родового и видового названия. При этом название рода пишется с заглавной буквы, а вида – со строчной: Staphylococcus aureus (S.aureus), Escherichia coli (E.coli). При повторном упоминании вида родовое название сокращается до начальной буквы, например E. Coli.

Род – фамилия автора, открывшего м/о или по морфологии бактерии, вид – морфология бактерий, место обитания в организме, географическое место выявления, клинические признаки. Например, Стафилококк золотистый – staphylococcus – гроздь винограда, шар, aureus - золотистый, Кишечная палочка – Escherichia – Эшерих, учёный, выделевший бактерию, coli – кишка, брюшнотифозная палочка - Salmonella – Сальмонь (ученый) typhy – туман, бред, Клостридиум тетани (столбняк) – Clostridium – веретено, tetani – судороги.

 

Вопрос № 1. Посеяли биологический материал на плотную питательную среду. Выросли разные по внешнему виду колонии микроорганизмов. Это чистая культура?

Вопрос № 2. Взяли биологический материал у пациента А и пациента Б, посеяли. В обоих случаях свойства чистой культуры оказались одинаковыми. Это один и тот же штамм микроорганизмов?