К факторам окружающей среды следует отнести климатические условия. Охлаждение или перегревание понижает устойчивость организма к патогенным и условно-патогенным микроорганизмам. В осенне-зимний сезон повышается заболеваемость гриппом и другими респираторными заболеваниями. На севере отмечена более высокая заболеваемость скарлатиной, чем на юге.
В условиях жаркого климата чаще регистрируются кишечные заболевания, в частности, амебная дизентерия.
Развитию инфекционных болезней способствует ионизирующая радиация в повышенных дозах, длительное и интенсивное действие солнечного света.
Немаловажную роль в возникновении и распространении инфекций играют плохие санитарно-гигиенические условия труда и быта людей, неблагоустроенность населенных пунктов, недостаточное водоснабжение и плохое качество питьевой воды, отсутствие ветеринарного надзора и др.