На практике встречаются ситуации, когда налогоплательщик после представления декларации, в которой заявлен НДС к возмещению, меняет адрес и встает на учет в новой налоговой инспекции.
Таким образом, возникает вопрос: кто должен возмещать налог - инспекция по прежнему месту учета или по новому?
Согласно разъяснениям ФНС России возмещать налог будет инспекция по новому месту учета налогоплательщика (Письмо от 18.12.2012 N ЕД-4-8/21578@).
В судебной практике вопрос о том, какая инспекция должна в этом случае возместить налог, решается по-разному. Большинство судов считает, что НДС должна возместить налоговая инспекция по новому месту учета. Хотя в некоторых случаях суды приходят к выводу, что налог должна возместить инспекция, где налогоплательщик прежде состоял на учете.
Правоприменительную практику по вопросу о том, какой налоговый орган должен возмещать налог и (или) проценты за несвоевременный возврат НДС при смене места учета налогоплательщика, см. в Энциклопедии спорных ситуаций по НДС.