Совместная деятельность различных категорий организмов, особенно продуцентов и редуцентов, обеспечивает круговорот отдельных элементов и химических соединений в природе. Этот круговорот называется биогеохимическим циклом.
Биогеохимический цикл состоит из двух незамкнутых циклов: биологического и геологического. В биологическом цикле вращается 95-98% всей массы химических элементов, 2-5% элементов ежегодно переходит в геологический цикл. Примерно столько же возвращается в биологический цикл, главным образом за счет сжигания ископаемого топлива.
Круговорот отдельных элементов можно рассмотреть на примере углерода, азота и фосфора.