НТВ, Гусинский и Березовский

В декабре 2000 года Борис Березовский эмигрировал в Лондон, не дожидаясь результатов расследования по «делу Аэрофлота». Тогда же он основал так называемый «Фонд гражданских свобод».24 января 2002 года официально обвинён в финансировании терроризма.После эмиграции в Лондон Борис Березовский неоднократно обвиняет ФСБ в попытках покушений на себя, а также выдвигает другие обвинения: в причастности ФСБ к терактам 1999 года и к гибели Александра Литвиненко.

Дело ЮКОСа

Дело Михаила Ходорковского вызвало резонанс в России и за рубежом.19 февраля 2003 года на встрече представителей крупного бизнеса с президентом России М. Ходорковский обвинил в коррупции государственную компанию «Роснефть», приведя в пример покупку небольшой нефтяной компании «Северная нефть» за баснословную по тем временам сумму $600 млн. В ответ Путин напомнил Ходорковскому, что «ЮКОС» имел проблемы с налогами (хотя и не уточнил какие) и поинтересовался, как нефтяная компания получила «сверхзапасы».Одной из причин начавшегося разгрома компании называли недовольство Путина финансированием Ходорковским и другими акционерами «ЮКОСа» российских партий, оппозиционных действовавшей на тот момент власти — «Яблока», СПС, КПРФ.Сторонники Ходорковского проводили разнообразные семинары, организовывали митинги и раздавали стикеры, в которых агитировали в свою пользу, упоминая, в частности, предпринятые Ходорковским усилия по обеспечению «прозрачности» бизнеса ЮКОСа.Дело вызвало резонанс, обеспокоенность судьбой Ходорковского выражал в том числе и президент США Джордж Буш. Дело ЮКОСа в конце 2004 было передано акционерами в суд города Хьюстон штата Техас. После саммита Путин-Буш в Братиславе весной 2005 судья выразил поддержку Ходорковскому, однако, отказался рассматривать дело, так как юрисдикция судов Соединённых Штатов не может распространяться за пределы их территории, и нарушение этого принципа создало бы в международном праве прецедент с непредсказуемыми последствиями.В 2005 году Ходорковский был осуждён к 9 годам лишения свободы, с отбыванием наказания в колонии в Краснокаменске, Читинской области.