Протеин S (ПS) - витамин-К-зависимый белок, синтезируемый в печени. Протеин S присутствует в плазме частично в свободном состоянии, частично в комплексе с С4-связывающим протеином (С4-СП), который доставляет протеин S на фосфолипидную мембрану. Это важно учитывать, так как комплекс протеин S - С4-СП не обладает кофакторной активностью по отношению к протеину С. Только свободный протеин S является кофактором АПС. Активность АПС в кооперации со свободным протеином S значительно выше, чем без него.
Дефицит nS, так же как и дефицит ПС, приводит к развитию тромбозов. Тяжесть течения тромбофилии при дефиците nS также пропорциональна степени снижения его активности, а гомозиготные формы дефицита nS неизвестны.
На рис. 53 схематично представлена последовательность взаимодействий компонентов системы протеин С - протеин S при инактивации фактора Va.