Некоторые дополнения к методичке «Ядро. Матричные процессы. Структура, функции и регуляция работы генов.»

1. Работа белка импортина (транспорт в ядро через поровый комплекс)

2. Работа белка экспортина (транспорт из ядра)

3. Фиксация ламины на ядерной оболочке

4. Схема строения порового комплекса (3 белковых кольца и ловчая сеть)

5. Схема строения порового комплекса (ядерная корзина)

6. Полная нуклеосома с гистоном Н1

7. Ядерный матрикс: 1)периферический (ламина), 2)внутренний (интерхроматиновая сеть + ядрышковая сеть).

8. Схема работы ядрышка в ядре

9. Вторичная перетяжка с генами рРНК

10. Состав ядрышка (в т.ч. белки ядрышковой сети)

11. Виды хроматина

12.

13. Политенные хромосомы – результат многократной репликации и нерасхождения новых молекул ДНК

14. Схема политенной хромосомы (диски и междиски)

15. Укорочение теломер при репликации в обычных клетках (верхние 2 рисунка слева, под исходной ДНК) и удлинение теломер ферментом теломераза в стволовых клетках (нижние 2 рисунка слева)

Удаление праймеров после окончания репликации (одноцепочечные бреши после вытеснения праймеров застраиваются ДНК-полимеразой, поэтому «дырок» в новой цепи после удаления праймеров не образуется).

Чаще всего дают такой рисунок репликона (см. ниже), но по определению в состав репликона должна входить ОДНА точка АРП! Таким образом, репликон – участок от точки терминации до точки терминации с одной АРП между ними (рисунок неверный).

16. Механизм экспансии коротких повторов нуклеотидов ДНК (по ошибке один и тот же участок реплицируется несколько раз, дочерняя цепь оказывается длиннее материнской)

17.

18.

19. Строение инициатора II для иРНК (нумерация нуклеотидов влево от СГ, с минусом)

20. Промотор (часть инициатора) и терминатор транскрипции ограничивают транскриптон; лидер и трейлер – участки будущей иРНК.

21. РНК может синтезироваться с разных генов по разным цепям ДНК в разных направлениях.

22. Палиндромный терминатор транскрипции (образование шпильки на РНК) и следом за ним олигоадениловый (где иРНК отрывается от матрицы ДНК).

23. Палиндромный терминатор

24. Незрелая тРНК

25. Незрелая и зрелая тРНК (зрелая имеет форму «бумерага»)

26. Присоединение «кэп» а к иРНК во время процессинга – метилированного ГТФ; образование связи 5^э- 5^э.

27. Взаимодействие энхансера/сайленсера с регуляторными белками, транскрипционными факторами и их общее влияние на присоединение/ не присоединение РНК-пол к промотору.

28. Последовательности нуклеотидов в начале, середине и конце интронов иРНК, узнаваемые при сплайсинге малой ядерной РНК (мяРНК).

Сейчас считают, что интроны не всегда разрушаются до нуклеотидов. Некоторые могут работать как регуляторные РНК.

29. Процессинг тРНК – вырезание интрона и модификация 3^э- конца (присоединение ЦЦА).

30. Начало процессинга тРНК – укорочение концов.

31. Процессинг рРНК: 5S – не изменяется, а предшественник 45S рРНК разрезается на 3 части.

32. Распределение рРНК по субъединицам рибосом.

33. Трансляция.

34. Альтернативный сплайсинг тяжелой цепи иммуноглобулина М- либо остается «трансмембранный» экзон, либо нет.

35. Механизм альтернативного сплайсинга иРНК

36. Виды мутагенов и повреждений ДНК

37. Дезаминирование азотистых оснований

38. Апуринизация азотистого основания

39. Одноцепочечные разрывы на хромосомах

40. Эксцизионная репарация ДНК.

41. Тиминовые димеры в одной цепи ДНК

42. Эксцизия димеров тимина

43. Фотореактивация (А) и эксцизия (Б, В) димеров тимина

44. Реактивация с участием метил-трансферазы

45. Эксцизия – сначала без разрыва фосфодиэфирной связи (разрыв гликозидной связи и удаление неправильного азотистого основания)- т.е. образование апиримидинового сайта, а затем разрыв фосфодиэфирной связи ДНК.

46. Индуцируемая репарация (SOS-репарация) – синтезируемые при наличии большого числа повреждений ДНК SOS-белки заставляют ДНК-полимеразу застраивать образующиеся при репликации одноцепочечные бреши (они образуются в дочерних цепях напротив повреждений) НЕ ПО ПРАВИЛУ КОМПЛЕМЕНТАРНОСТИ.