В период с 2013 года Отделом по взаимоотношениям Церкви и общества, а с 2015 года – Отделом по взаимоотношениям Церкви с обществом и СМИ осуществлялась работа в совещательных органах Администрации Президента Российской Федерации. Традиционно председатель отдела возглавляет Комиссию по вопросам гармонизации межнациональных и межрелигиозных отношений Совета по взаимодействию с религиозными объединениями при Президенте Российской Федерации. В указанный период состоялось восемь заседаний, в ходе которых предметом обсуждения стали вопросы мониторинга ситуаций, чреватых межнациональными и межрелигиозными конфликтами, в частности, резонансных инцидентов, следственных и судебных процессов, проведения профилактических мероприятий и теоретической разработки концептуальных вопросов межнациональных и межрелигиозных отношений в России.
В 2016 году представители отдела были также включены в рабочие органы Совета: Комиссию по совершенствованию законодательства и правоприменительной практики и Рабочую группу по выработке и практической реализации мер по профилактике радикализма среди верующих и развития межрелигиозного диалога.
Председатель отдела является членом Общественного совета при Уполномоченном при Президенте Российской Федерации по правам ребенка.
С 2013 года во взаимодействии с Юридической службой Московской Патриархии были подготовлены поправки в 35 законопроектов и пять подзаконных актов. Сотрудничество с законодателями проходило в следующих сферах: внесение изменений в законодательные акты, относящиеся к храмоздательству, взаимодействие с Министерством по чрезвычайным ситуациям Российской Федерации, природоохранное законодательство, сфера миссионерства и молодежной политики.
В рассматриваемый период осуществлялось взаимодействие с органами исполнительной власти Российской Федерации:
· Министерством регионального развития (упразднено в 2014 году) — по вопросам регионального развития и деятельности епархий Русской Православной Церкви, а также участию церковных учреждений в федеральных программах,
· Министерством по развитию Дальнего Востока — по вопросам жизнедеятельности дальневосточных епархий, Министерством иностранных дел — в связи с подготовкой визитов и встреч Святейшего Патриарха Кирилла,
· Министерством здравоохранения — относительно выведения абортов из системы обязательного медицинского страхования (ОМС),
· Министерством труда и социальной защиты — по вопросам социального обеспечения различных категорий нуждающихся граждан,
· Министерством строительства и жилищно-коммунального хозяйства — по вопросам комплексного развития Соловецкого архипелага и восстановления Соловецкого монастыря, а также иным вопросам, затрагивающим жизнь и деятельность Русской Православной Церкви.
Были подписаны следующие соглашения:
· 19 апреля 2013 года — о взаимодействии Русской Православной Церкви и Федеральной миграционной службы,
· 18 июня 2015 года — о сотрудничестве между Русской Православной Церковью и Министерством здравоохранения Российской Федерации,
· 24 июля 2015 года — о сотрудничестве между Русской Православной Церковью и Счетной палатой Российской Федерации.
По многим вопросам, затрагивающим жизнедеятельность Русской Православной Церкви, проводились встречи и консультации с заместителями председателя Правительства Российской Федерации.
Представители Отдела участвовали в работе общественных советов при федеральных органах исполнительной власти: Министерства юстиции Российской Федерации, Министерства образования и науки Российской Федерации, Федеральной службы по труду и занятости, Федеральной службы государственной статистики, Федеральной миграционной службы Российской Федерации.
За указанный период состоялось три заседания совместной комиссии Русской Православной Церкви и Федеральной миграционной службы Российской Федерации. Основными вопросами для обсуждения и направлениями сотрудничества стали: взаимодействие в сфере интеграции и адаптации мигрантов, содействия добровольному переселению в Российскую Федерацию соотечественников, проживающих за рубежом, развитие сотрудничества между территориальными управлениями ФМС России и епархиями Русской Православной Церкви, подготовка учебных и методических материалов для мигрантов и сотрудников территориальных органов ФМС России. На каждом заседании обсуждался вопрос о тенденции к внедрению в России новых форм персональных документов.