Министерства с трудом вживались в государственный быт России. Следовало продолжать реформы. Дальше происходило упразднение коллегий, управлений и служб.
В июле 1806 г. прекратила существование Берг-коллегия, передав свои полномочия Горному департаменту Министерства финансов. Таким образом, процесс упразднения коллегий вышел за пределы Министерства внутренних дел. При этом, борьба и напряжение в высших эшелонах власти нарастали.
Законодательные меры 1803-1809 гг. подготовили почву для проведения министерской реформы 1810-1811 гг.
Сенат утратил свои преимущества, а Комитет министров, напротив, получил значение высшего законодательного, исполнительного судебного учреждения. Возвышение Комитета министров над Сенатом и (Государственным) Советом способствовало усилению министерского начала. Ослабление Сената сделало власть министров фактически бесконтрольной.