Прогноз племенной ценности быков-производителей осуществляется на основе решения уравнения смешанной модели по методологии наилучшего линейного несмещенного предсказания (BLUP).
Этот метод позволяет прогнозировать племенную ценность быков-производителей с учетом года и сезона отела дочерей; паратипических различий в стадах, где лактировали дочери; Генетических групп, к которым относятся проверяемые быки-производители; возраста отела дочерей проверяемых быков.
Для сравнения племенной ценности быков-производителей, принадлежащих к различным генерациям (поколениям) животных, используют «скользящую» базу сравнения (rolling base) с учетом информации за ряд смежных (до 5) лет.
Исходное уравнение для прогноза племенной ценности быков-производителей в матричной форме имеет вид:

где y – вектор значений селекционных признаков (удой, % жира и т. д.); X – матрица фиксированных эффектов (представляет собой распределение дочерей быков-производителей по градациям фиксированных эффектов в модели); b – неизвестный вектор эффектов, представленных в модели как фиксированные; Z – матрица рандомизированных эффектов исходной модели (представляет собой распределение первотелок по отцам); u – вектор неизвестных случайных эффектов; e – вектор остаточных (неучтенных) эффектов модели.
(Красота В. Ф., Джапоридзе Т. Г., Костомахин Н. М., 2005)






