Синтетазы (или лигазы)

6-1-1 аминоацил транспортной РНК синтетазы

6-2 образуются углерод-серные связи, кислотно-тиоловые лигазы.

6-4 ацетилкоэнзим-А-карбоксилаза, с помощью неё происходит образование углерод-углеродных связей.

Механизм ферментативного действия.

Превращение субстрата в продукты реакции под влиянием ферментов может быть выражено в общем виде

Образование промежуточных комплексов требует меньше энергии, чем непосредственное превращение субстрата.

Все молекулы в системе должны обладать каким-то запасом энергии, чтобы превратиться продукты реакции. Образование разных фермент-субстратных комплексов приводит к тому, что энергетический барьер каждого субстратного комплекса значительно ниже, чем общий барьер реакции.

Теория индуцированного состояния.

Согласно этой теории, фермент связывается с правильным субстратом и сам фермент приобретает в процессе некоторое изменение – индуцированное соответствие (состояние).

Образование фермент-субстратного комплекса происходит индуцированное соответствие – фермент и субстрат претерпевают структурные изменения, чтобы соответствовать друг другу.

Факторы, которые способствуют:

1. Сближении и ориентация фермента и субстрата, в результате этого атакуемая ферментом связь оказывается не только расположенной в непосредственной близости от каталитического центра, но и правильно ориентирована.

2. Общий кислотно-основной катализ. В активном центре фермента, как правило находятся группы специфических аминокислотных остатков, которые являются хорошими донорами протонов и хорошими акцепторами протонов (протонодонорные карбоксильная, гидрокси, сульфгидрильная; протоноакцепторные: карбокси-группа, NH₂, S^-, O^-; сульфгидрильная группа может быть как протонодонорной, так и протоноакцепторной).

3. Ковалентный катализ

Хемотрепсин – это полипептид, содержащий 245 аминокислотных остатков, имеет 5 дисульфидных мостиков.

57 – гистидин;

102 – аспарагиновая кислота;

195 – сирин;

Неактивный хемотрепсин превращается в активную форму превращается после того, как под действием фермента трепсина и активного хемотрепсина расщепляются 4 пептидные связи. Но удерживается дисульфидными связями.

Это был процесс расщепления пептидной связи под действием хемотрепсина в активном состоянии.