Способность использовать энергию света обуславливается наличием у большинства фототрофных микроорганизмов специфических пигментов – бактериохлорофиллов и каротиноидов.
Световая энергии улавливается системой поглощающих свет пигментов и передается на молекулу хлорофилла, которая переходит в возбужденное состояние вследствие перехода одного из электронов на более высокий энергетический уровень. Переходя по цепи переноса, электрон отдает свою энергию системе АДФ-АТФ, в результате чего энергия света трансформируется в энергию макроэргической связи молекулы АТФ, т.е. происходит фотосинтетическое фосфорилирование, которое бывает циклическое и нециклическое. В случае циклического процесса электрон возвращается к исходному донору, отдавая полученную им энергию в процессе перехода через ряд переносчиков по термодинамическому закону, одним из таких переносчиков является цитохром с, обеспечивающий фосфорилирование: АДФ. При нециклическом фосфорилировании возбужденный электрон передается на НАД+ с образованием НАДН2.
У фотосинтетических бактерий донорами водорода для реакций синтезе могут быть как неорганические, так и органические вещества. Фотолитоавтотрофы используют в качестве донора водорода Н2S: свет
СО2 + Н2S → (СН2О) + Н2О + 2 S
Такой вид фотосинтеза называется фоторедукцией. Основное отличие бактериальной фоторедукции от фотосинтеза зеленых растений и водорослей следующие: бактериальный фотосинтез протекает в анаэробных условиях и не сопровождается выделением кислорода; донором водорода для восстановления СО2 в большинстве случаев является сероводород, а не вода.
Микроскопические водоросли и цианобактерии (как и высшие растения) фотосинтез осуществляют с выделением О2, донором электронов (водорода) служит вода:
свет
СО2 + Н2О → (СН2О) + О2
Питание микроорганизмов