Проведение границы между четвертичными и неогеновыми отложениями является одним из трудных вопросов стратиграфии, он обсуждался на разных совещаниях. Однако до сих пор остается нерешенным. Одни исследователи считают необходимым опустить эту границу, другие - оставить неизменной. Официально нижней границей четвертичной системы в России продолжает считаться подошва Бакинских (на Каспии), Чаудинских (на Черном море), Миндельских (в Альпах) слоев.
Длительность четвертичного периода в его этих "старых" границах исчислялась обычно в 600-750 тыс. лет.
В других странах четвертичный период понимают значительно шире.
За рубежом эталоном нижней границы антропогеновой системы считается основание морских калабрййских и основание континентальных средневиллафранских слоев Италии. Mногие российские исследователи включают в антропогенную систему аналоги этих отложений - акчагыльские и апшеронские слои. Однако большинство исследователей следует принятой в России шкале, согласно которой они (акчагыл + апшерон) относятся к неогеновой системе (верхний плиоцен).
В разных литературных источниках можно встретить разное толкование о нижней границе четвертичной системы. Чтобы окончательно решить проблему, надо ответить на ряд вопросов. Остановимся на некоторых из них.