Патологический материал, культуры МБТ, полученные при посеве, предметные стекла, контейнеры, лабораторная посуда, ватно-марлевые и резиновые пробки, средства индивидуальной защиты, оборудование должны быть дезинфицированы, а еще лучше – стерилизованы после их использования. Термином стерилизация обозначают полное уничтожение всех микроорганизмов, тогда как под дезинфекцией понимают уничтожение патогенных микроорганизмов. Для стерилизации обычно используют высокую температуру, а для дезинфекции – обработку химическими веществами. Метод замораживания-оттаивания не пригоден для уничтожения микроорганизмов, в том числе микобактерий.
Все поверхности и оборудование в лаборатории должны рассматриваться как потенциально опасные в плане их загрязнения инфекционным материалом, поэтому их следует регулярно мыть и обрабатывать соответствующим образом.