Различия ДНК близкородственных микроорганизмов с целью идентификации или типирования, а также мутации могут быть выявлены с помощью метода ПЦР – ПДРФ анализа.
| | | | | | |
| | | 
1 2 3 4 5
| |
| |
| | |
| | | 
1 2 3 4 5
| |
| |
Рис. 15. Результаты ПЦР-ПДРФ анализа 16 S рРНК генов для идентификации Bacteroides spp.: а ‑ продукты амплификации 16 S рРНК Bacteroides spp. (разные видыобразуют продукты одного размера – видна одна полоса ); b и c ‑ hpa II и taq I рестрикционные профили Bacteroides spp.: треки 1, 2, 5 – B. thetaiotaomicron треки 3, 4 – B. fragilis
Под действием ферментов рестрикции амплифицированные участки ДНК нарезаются на различного размера фрагменты, которые при гель-электрофорезе образуют профили, идентифицируемые как определенный вид или тип микроорганизмов. Метод включает последовательное проведение: 1) экстракции ДНК, 2) ПЦР амплификации определенных генов, или их фрагментов, в результате чего генерируются мономорфные ДНК фрагменты, 3) рестрикции эндонуклеазами; 5) электрофореза рестрицированных образцов, 6) визуализации и анализа.
2015-05-26
635
