Региональный уровень управления образуют министерства внутренних дел республик в составе РФ, главные управления и управления внутренних дел администраций краев, областей, городов — всего 98 органов.
При управлениях внутренних дел на местах созданы специализированные подразделения — информационные центры (ИЦ). Кроме того, в аппаратах отраслевых служб имеются информационно-аналитические группы.
На региональном уровне формируются информационные фонды: о лицах, проходящих по материалам и делам оперативного учета, уголовным делам; о лицах, осужденных за совершение преступлений; о лицах, разыскиваемых и без вести пропавших, неопознанных трупах граждан; о владельцах огнестрельного оружия, об автотранспортных средствах; о предметах преступного посягательства и орудиях совершения преступлений; дактилоскопические учеты и фотоучеты и т. д.
Создаются криминалистические картотеки дактилоскопических следов с мест совершения нераскрытых преступлений. Средний объем регионального информационного фонда — три-четыре миллиона документов.
В зональных информационных центрах аккумулируются данные о криминальных фактах, имеющих значение для группы регионов. При этом частично дублируются сведения региональных центров и отраслевых служб.