| № | Признак | Прокариоты | Эукариоты |
| Величина клетки в наименьшем измерении (ширина или диаметр) | 0,2-2,0 мкм | более 2,0 мкм | |
| Генетический материал | Нуклеоид (кольцевая молекула ДНК) | Хромосома | |
| Расположение генетического материала | Свободно в цитоплазме, не отделен мембраной | Ограничен от цитоплазмы ядерной мембраной | |
| Внехромосомная ДНК | Располагается в плазмидах | Располагается в митохондриях | |
| Гистоны | - | + | |
| Митохондрии | - | + | |
| Хлоропласты | - | + | |
| Вакуоли | - | + | |
| Аппарат Гольджи | - | + | |
| Лизосомы | - | + | |
| Эндоплазматический ретикулум | - | + | |
| Рибосомы (константа седиментации) | 70S (50S и 30S) | 80S (60S и 40S) | |
| Локализация рибосом | Свободно рассеяны в цитоплазме | Прикреплены к эндоплазматической сети | |
| Деление клетки | Не сопровождается циклическими изменениями консистенции и способности к окрашиванию | + | |
| Тип деления | Бинарный | Митотический | |
| Эндоспоры | + | - | |
| Клеточная стенка, представленная пептидогликаном | + | - | |
| Стеролы | - | + | |
| Тейхоевые кислоты (в составе клеточной стенки) | +* | - | |
| Диаминопимелиновая кислота | +* | - | |
| Мурамовая кислота | +* | - | |
| Питание | Клетки поглощают питательные вещества в виде растворимых мелких молекул | Различное | |
| Хемотрофный тип метаболизма | + | - | |
| Тип дыхания | Аэробное и анаэробное | Аэробное |
Примечание: «+» - наличие признака; «-» - отсутствие признака; «+*» - присутствуют у микроорганизмов, имеющих клеточную стенку.
1. Бактерии – Schizomycetes – грибы-дробянки (от лат. schizo -расщепляю, mycetes -грибы)
2. Лучистые грибы – Actinomycetes (от лат. actin -луч)
3. Нитчатые грибы – Trichomycetes (от греч. trichos -волос)
4. Дрожжевые грибы – Blastomycetes (от греч. blastos-почка, разможаются почкованием)
5. Синезеленые водоросли (Cyanophyta), они же цианобактерии (Cyanobacteria)
6. Спирохеты – Spirochaeta (от греч. speira -спираль, chaite -волос)
7. Простейшие – Protozoa
8. Риккетсии – Rickettsia
9. Микоплазмы – Mycoplasma
Вирусы






