Фермент катализирует последовательное удаление 5'ф-мононуклеотидов с 3'ОН-концов двунигевых ДНК. Его используют для подготовки образцов ДНК с целью определения нуклеотидной последовательности по методу Сэнгера. В сочетании с нуклеазой S1 он применяется для укорочения фрагментов ДНК:
Экзонуклеаза III на одно- или двунитевых ДНК с 3' ф-концами обладает также З'-фосфатазной активностью и катализирует реакцию 3'ф → 3'ОН.
Другие ферменты.