Просмотр структуры

Примечание. Недоступно в TOPAS P

Окно просмотра структуры позволяет увидеть структуру кристалла (рис. 5-1) и объемные электронные плотности, включая выборку атомов (рис. 5-2). По мере продолжения процесса уточнения, отображение структуры обновляется в виде объемного анимированного уточнения.

Рис. 5-1: Окно просмотра структуры со структурой кристалла (уточнение методом Ритвельда).

Рис. 5-2: Окно просмотра структуры, где показана карта объемной электронной плотности, полученной методом переворота заряда, включая результаты выборки атомов.

В GUI-режиме можно открыть окно просмотра структуры, используя элемент View/Hide Structure элемента Structure (см. раздел 4.2.2.8). В режиме запуска, можно использовать ключевое слово view_structure (см. техническое справочное руководство).

Структуры/объемные электронные плотности можно вращать, нажав левую кнопку мыши и перемещая мышь. Масштабирование осуществляется нажатием правой кнопки и перемещением мыши.

Чтобы повернуть структуру/объемную электронную плотность вокруг оси, перпендикулярной экрану компьютера, нажмите одновременно клавишу Shift и левую кнопку мыши и перемещайте мышь. Чувствительность вращения уменьшается по мере удаления мыши от центра окна, что позволяет более точно установить объекты.

Значок	Результат
	Переключение между окнами просмотра структуры и редактора жесткого тела
	Отображение в виде перспективы или в ортогональном отображении
	Отображение подсветки
	Отображение функций просмотра, включая диалоговые окно вращения и перевода
	Покачивание отображения вокруг оси перпендикулярной экрану компьютера
	Показать/скрыть стенки ячеек
	Показать/скрыть названия атомов
	Показать/скрыть шары
	Показать атомы, используя ожидаемый размер
	Показать/скрыть связи между атомами
	Показать/скрыть многогранники
	Показать несколько ячеек
	Убрать атомы за пределами ячейки
	Показать плоскости отрезания и соответствующее диалоговое окно
	Окно временного вывода Показать выбранные атомы в формате z-матрицы
	Диалоговое окно облачных функций. Показывает параметры объемного отображения электронных плотностей и позволяет провести выборку атомов с учетом или без учета симметрии

Щелчок правой кнопкой мыши в любом месте окна просмотра откроет меню быстрого доступа, в котором будут следующие функции:

· Set rotation position at geometric center («Установить позицию вращения в геометрическом центре»)

· Set rotation position at atom under mouse («Установить позицию вращение на атоме под мышью»)

· Set rotation position at eye («Установить позицию вращения на уровне глаз»)

· Keep rotation position at center of view («Оставить позицию вращения в центре отображения»)

· Show connecting atoms for selection («Показать связанные атомы для выделения»)

· Hide selection («Скрыть выделение»)

· New polygon connecting selected atoms («Новый многогранник с соединением выбранных атомов»)

· Show connecting atoms («Показать связанные атомы»)

· Hide connecting atoms («Скрыть связанные атомы»)

· Isolate atom / polyhedra under mouse («Изолировать атом/многогранник под мышью»)