Наиболее колонизированы верхние отделы дыхательных путей, которые анатомически приспособлены для осаждения бактерий из вдыхаемого воздуха.
Резидентная микрофлора полости носа и носоглотки представлена
грамположительными зеленящими и негемолитическими стрептококками, пептострептококками, микрококками, стафилококками, лактобациллами. Из грамотрицательных микроорганизмов здесь обитают непатогенные нейссерии и
анаэробные неспорообразующие палочки – бактероиды.