Эксперимент можно проводить одномоментно или в течение нескольких месяцев в зависимости от выбранного дизайна. Важно соблюдать одинаковые условия для всех обследуемых (время суток, наличие предшествующей нагрузки, прием пищи и т.д.), если они могут повлиять на его результат.
Как в основной (группе, в которой планируется применение предложенного комплекса, либо избранного метода), так и в контрольной группе обследование проводится дважды. Первичное обследование позволяет выявить особенности состояния здоровья, физического развития, физиологических особенностей, особенностей течения заболевания лиц, принимающих участие в обследовании, а так же получить базу для сравнения с результатами, которые будут получены при повторном обследовании.
Результаты исследования заносятся в специальные бланки, предоставленные лабораторией, в которой проводятся исследования, либо разработанные магистрантом, совместно с научным руководителям. На основании записей в этих бланках составляются таблицы для статистической обработки результатов.
После определения дизайна исследования магистрант, совместно с научным руководителем оформляют задание на выпускную квалификационную работу (Приложение А) и календарный план работы над проектом (Приложение Б).